Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCLK1O15075 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLK1O15075 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DCLK1O15075 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms