Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCANO14594 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCANO14594 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCANO14594 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCANO14594 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCANO14594 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NCANO14594 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCANO14594 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCANO14594 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCANO14594 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCANO14594 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCANO14594 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCANO14594 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCANO14594 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NCANO14594 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCANO14594 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCANO14594 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCANO14594 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCANO14594 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCANO14594 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCANO14594 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NCANO14594 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCANO14594 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCANO14594 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCANO14594 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCANO14594 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCANO14594 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCANO14594 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCANO14594 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCANO14594 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCANO14594 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCANO14594 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCANO14594 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCANO14594 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCANO14594 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCANO14594 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCANO14594 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCANO14594 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCANO14594 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCANO14594 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCANO14594 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCANO14594 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCANO14594 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCANO14594 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCANO14594 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCANO14594 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCANO14594 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCANO14594 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCANO14594 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCANO14594 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCANO14594 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCANO14594 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCANO14594 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCANO14594 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCANO14594 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCANO14594 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCANO14594 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCANO14594 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCANO14594 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCANO14594 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCANO14594 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCANO14594 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCANO14594 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCANO14594 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCANO14594 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCANO14594 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCANO14594 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCANO14594 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCANO14594 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCANO14594 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCANO14594 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCANO14594 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCANO14594 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCANO14594 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCANO14594 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCANO14594 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCANO14594 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCANO14594 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCANO14594 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCANO14594 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCANO14594 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCANO14594 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCANO14594 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCANO14594 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCANO14594 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCANO14594 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCANO14594 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCANO14594 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms