Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac1O09106 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac1O09106 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac1O09106 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac1O09106 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms