Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PbsnO08976 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PbsnO08976 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PbsnO08976 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PbsnO08976 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PbsnO08976 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PbsnO08976 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PbsnO08976 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PbsnO08976 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PbsnO08976 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PbsnO08976 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PbsnO08976 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PbsnO08976 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PbsnO08976 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PbsnO08976 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PbsnO08976 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PbsnO08976 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PbsnO08976 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PbsnO08976 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PbsnO08976 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PbsnO08976 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PbsnO08976 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PbsnO08976 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PbsnO08976 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PbsnO08976 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PbsnO08976 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PbsnO08976 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PbsnO08976 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PbsnO08976 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PbsnO08976 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PbsnO08976 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PbsnO08976 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PbsnO08976 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms