Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Flot1O08917 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flot1O08917 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Flot1O08917 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Flot1O08917 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flot1O08917 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Flot1O08917 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flot1O08917 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flot1O08917 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flot1O08917 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Flot1O08917 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Flot1O08917 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Flot1O08917 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Flot1O08917 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Flot1O08917 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
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