Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc3aO08576 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc3aO08576 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms