Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC024978J3QPC3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC024978J3QPC3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC024978J3QPC3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms