Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
Ccdc180J3QNE4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Ccdc180J3QNE4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ccdc180J3QNE4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Ccdc180J3QNE4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ccdc180J3QNE4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ccdc180J3QNE4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms