Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lipo1J3QME6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lipo1J3QME6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lipo1J3QME6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lipo1J3QME6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lipo1J3QME6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lipo1J3QME6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms