Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28051J3QMA2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms