Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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Tmem200cJ3QK46 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem200cJ3QK46 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Tmem200cJ3QK46 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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Tmem200cJ3QK46 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Tmem200cJ3QK46 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200cJ3QK46 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Tmem200cJ3QK46 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Tmem200cJ3QK46 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Tmem200cJ3QK46 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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