Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf4bG5E8Z2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms