Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b1G5E829 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms