Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
BicraF8VPZ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
BicraF8VPZ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
BicraF8VPZ9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
BicraF8VPZ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
BicraF8VPZ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
BicraF8VPZ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC39.52■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
BicraF8VPZ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
BicraF8VPZ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
BicraF8VPZ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC39.33■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BicraF8VPZ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
BicraF8VPZ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms