Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Ercc6F8VPZ5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ercc6F8VPZ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ercc6F8VPZ5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ercc6F8VPZ5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ercc6F8VPZ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ercc6F8VPZ5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ercc6F8VPZ5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ercc6F8VPZ5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ercc6F8VPZ5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ercc6F8VPZ5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ercc6F8VPZ5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms