Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms