Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf212F6TQD1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnf212F6TQD1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf212F6TQD1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms