Protein–RNA interactions for Protein: E9PY39

Gm20431, Predicted gene 20431, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20431E9PY39 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20431E9PY39 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20431E9PY39 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20431E9PY39 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20431E9PY39 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20431E9PY39 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20431E9PY39 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20431E9PY39 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm20431E9PY39 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20431E9PY39 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20431E9PY39 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms