Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PROB1E7EW31 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PROB1E7EW31 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms