Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPK3BL2E5RIL1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UPK3BL2E5RIL1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms