Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Soga1E1U8D0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Soga1E1U8D0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Soga1E1U8D0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Soga1E1U8D0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms