Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrc5C3VPR6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrc5C3VPR6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc5C3VPR6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms