Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptprz1B9EKR1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptprz1B9EKR1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptprz1B9EKR1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptprz1B9EKR1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptprz1B9EKR1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptprz1B9EKR1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptprz1B9EKR1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptprz1B9EKR1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms