Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CatipB9EKE5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CatipB9EKE5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CatipB9EKE5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CatipB9EKE5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CatipB9EKE5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CatipB9EKE5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CatipB9EKE5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CatipB9EKE5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CatipB9EKE5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CatipB9EKE5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CatipB9EKE5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CatipB9EKE5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CatipB9EKE5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CatipB9EKE5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CatipB9EKE5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CatipB9EKE5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CatipB9EKE5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms