Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm6133B2RY53 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm6133B2RY53 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm6133B2RY53 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6133B2RY53 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6133B2RY53 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm6133B2RY53 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms