Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms