Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrn3B2RS91 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms