Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ythdc2B2RR83 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ythdc2B2RR83 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ythdc2B2RR83 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.1 ms