Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfx1B1AY10 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfx1B1AY10 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nfx1B1AY10 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfx1B1AY10 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfx1B1AY10 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfx1B1AY10 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfx1B1AY10 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms