Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prr29B1ARI9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Prr29B1ARI9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prr29B1ARI9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prr29B1ARI9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms