Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZK1P1A8MUH7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1P1A8MUH7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZK1P1A8MUH7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZK1P1A8MUH7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZK1P1A8MUH7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZK1P1A8MUH7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZK1P1A8MUH7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZK1P1A8MUH7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZK1P1A8MUH7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms