Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARID3CA6NKF2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ARID3CA6NKF2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ARID3CA6NKF2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.9 ms