Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POTEMA6NI47 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEMA6NI47 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEMA6NI47 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms