Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6CA6NDK9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms