Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00862A6NCI5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms