Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A4D1N5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A4D1N5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4D1N5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4D1N5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4D1N5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4D1N5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4D1N5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4D1N5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4D1N5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4D1N5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4D1N5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4D1N5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4D1N5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4D1N5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4D1N5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4D1N5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4D1N5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4D1N5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4D1N5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4D1N5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
A4D1N5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4D1N5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4D1N5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4D1N5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4D1N5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4D1N5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4D1N5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4D1N5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4D1N5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4D1N5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4D1N5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4D1N5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4D1N5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4D1N5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4D1N5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4D1N5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4D1N5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4D1N5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4D1N5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4D1N5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4D1N5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4D1N5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4D1N5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4D1N5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4D1N5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4D1N5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4D1N5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4D1N5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4D1N5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4D1N5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4D1N5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A4D1N5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4D1N5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4D1N5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4D1N5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4D1N5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4D1N5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4D1N5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4D1N5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4D1N5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4D1N5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4D1N5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4D1N5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4D1N5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4D1N5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4D1N5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4D1N5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4D1N5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
A4D1N5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4D1N5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms