Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fibcd1A2AV25 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms