Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syndig1A2ANU3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syndig1A2ANU3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms