Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hacd4A2AKM2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms