Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chd7A2AJK6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chd7A2AJK6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd7A2AJK6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.9 ms