Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Col9a3A2ACT7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col9a3A2ACT7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a3A2ACT7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms