Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Itgb4A2A863 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itgb4A2A863 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itgb4A2A863 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms