Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l1A2A259 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l1A2A259 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms