Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
POTEB3A0JP26 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
POTEB3A0JP26 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms