Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms