Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cldn6Q9Z262 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cldn6Q9Z262 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cldn6Q9Z262 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cldn6Q9Z262 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cldn6Q9Z262 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cldn6Q9Z262 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cldn6Q9Z262 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cldn6Q9Z262 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cldn6Q9Z262 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cldn6Q9Z262 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cldn6Q9Z262 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn6Q9Z262 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cldn6Q9Z262 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cldn6Q9Z262 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cldn6Q9Z262 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cldn6Q9Z262 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cldn6Q9Z262 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldn6Q9Z262 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldn6Q9Z262 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cldn6Q9Z262 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn6Q9Z262 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn6Q9Z262 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn6Q9Z262 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldn6Q9Z262 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cldn6Q9Z262 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cldn6Q9Z262 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldn6Q9Z262 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldn6Q9Z262 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldn6Q9Z262 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldn6Q9Z262 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldn6Q9Z262 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldn6Q9Z262 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldn6Q9Z262 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldn6Q9Z262 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cldn6Q9Z262 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldn6Q9Z262 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldn6Q9Z262 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cldn6Q9Z262 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cldn6Q9Z262 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cldn6Q9Z262 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn6Q9Z262 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cldn6Q9Z262 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cldn6Q9Z262 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldn6Q9Z262 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldn6Q9Z262 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cldn6Q9Z262 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cldn6Q9Z262 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cldn6Q9Z262 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cldn6Q9Z262 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cldn6Q9Z262 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cldn6Q9Z262 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cldn6Q9Z262 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cldn6Q9Z262 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cldn6Q9Z262 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cldn6Q9Z262 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cldn6Q9Z262 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cldn6Q9Z262 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cldn6Q9Z262 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cldn6Q9Z262 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cldn6Q9Z262 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cldn6Q9Z262 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cldn6Q9Z262 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cldn6Q9Z262 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cldn6Q9Z262 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn6Q9Z262 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cldn6Q9Z262 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cldn6Q9Z262 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cldn6Q9Z262 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn6Q9Z262 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn6Q9Z262 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cldn6Q9Z262 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cldn6Q9Z262 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cldn6Q9Z262 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cldn6Q9Z262 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cldn6Q9Z262 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn6Q9Z262 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn6Q9Z262 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn6Q9Z262 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn6Q9Z262 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cldn6Q9Z262 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cldn6Q9Z262 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn6Q9Z262 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn6Q9Z262 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn6Q9Z262 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn6Q9Z262 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn6Q9Z262 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cldn6Q9Z262 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cldn6Q9Z262 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cldn6Q9Z262 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cldn6Q9Z262 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn6Q9Z262 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn6Q9Z262 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cldn6Q9Z262 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn6Q9Z262 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cldn6Q9Z262 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cldn6Q9Z262 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cldn6Q9Z262 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cldn6Q9Z262 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn6Q9Z262 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
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