Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DDX49Q9Y6V7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DDX49Q9Y6V7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DDX49Q9Y6V7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DDX49Q9Y6V7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDX49Q9Y6V7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDX49Q9Y6V7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
DDX49Q9Y6V7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
DDX49Q9Y6V7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
DDX49Q9Y6V7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
DDX49Q9Y6V7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
DDX49Q9Y6V7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
DDX49Q9Y6V7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DDX49Q9Y6V7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DDX49Q9Y6V7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DDX49Q9Y6V7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDX49Q9Y6V7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDX49Q9Y6V7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDX49Q9Y6V7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDX49Q9Y6V7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DDX49Q9Y6V7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DDX49Q9Y6V7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DDX49Q9Y6V7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX49Q9Y6V7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX49Q9Y6V7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDX49Q9Y6V7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DDX49Q9Y6V7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DDX49Q9Y6V7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
DDX49Q9Y6V7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
DDX49Q9Y6V7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
DDX49Q9Y6V7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
DDX49Q9Y6V7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
DDX49Q9Y6V7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DDX49Q9Y6V7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DDX49Q9Y6V7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
DDX49Q9Y6V7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DDX49Q9Y6V7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DDX49Q9Y6V7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DDX49Q9Y6V7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
DDX49Q9Y6V7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DDX49Q9Y6V7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX49Q9Y6V7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DDX49Q9Y6V7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
DDX49Q9Y6V7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DDX49Q9Y6V7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DDX49Q9Y6V7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DDX49Q9Y6V7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DDX49Q9Y6V7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DDX49Q9Y6V7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
DDX49Q9Y6V7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DDX49Q9Y6V7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DDX49Q9Y6V7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DDX49Q9Y6V7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDX49Q9Y6V7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDX49Q9Y6V7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DDX49Q9Y6V7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
DDX49Q9Y6V7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
DDX49Q9Y6V7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DDX49Q9Y6V7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
DDX49Q9Y6V7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DDX49Q9Y6V7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DDX49Q9Y6V7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DDX49Q9Y6V7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDX49Q9Y6V7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DDX49Q9Y6V7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DDX49Q9Y6V7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DDX49Q9Y6V7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DDX49Q9Y6V7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DDX49Q9Y6V7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DDX49Q9Y6V7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DDX49Q9Y6V7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DDX49Q9Y6V7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DDX49Q9Y6V7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
DDX49Q9Y6V7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DDX49Q9Y6V7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DDX49Q9Y6V7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
DDX49Q9Y6V7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DDX49Q9Y6V7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DDX49Q9Y6V7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DDX49Q9Y6V7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DDX49Q9Y6V7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DDX49Q9Y6V7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DDX49Q9Y6V7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DDX49Q9Y6V7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DDX49Q9Y6V7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DDX49Q9Y6V7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DDX49Q9Y6V7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DDX49Q9Y6V7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DDX49Q9Y6V7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DDX49Q9Y6V7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DDX49Q9Y6V7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
DDX49Q9Y6V7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
DDX49Q9Y6V7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DDX49Q9Y6V7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
DDX49Q9Y6V7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
DDX49Q9Y6V7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DDX49Q9Y6V7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DDX49Q9Y6V7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DDX49Q9Y6V7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DDX49Q9Y6V7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms