Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPTNQ9Y664 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPTNQ9Y664 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPTNQ9Y664 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPTNQ9Y664 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPTNQ9Y664 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPTNQ9Y664 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPTNQ9Y664 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPTNQ9Y664 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPTNQ9Y664 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPTNQ9Y664 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPTNQ9Y664 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPTNQ9Y664 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KPTNQ9Y664 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KPTNQ9Y664 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPTNQ9Y664 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPTNQ9Y664 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPTNQ9Y664 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPTNQ9Y664 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KPTNQ9Y664 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KPTNQ9Y664 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPTNQ9Y664 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KPTNQ9Y664 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KPTNQ9Y664 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KPTNQ9Y664 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPTNQ9Y664 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KPTNQ9Y664 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPTNQ9Y664 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPTNQ9Y664 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPTNQ9Y664 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPTNQ9Y664 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPTNQ9Y664 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPTNQ9Y664 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPTNQ9Y664 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPTNQ9Y664 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPTNQ9Y664 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPTNQ9Y664 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPTNQ9Y664 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPTNQ9Y664 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPTNQ9Y664 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPTNQ9Y664 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPTNQ9Y664 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KPTNQ9Y664 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KPTNQ9Y664 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KPTNQ9Y664 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPTNQ9Y664 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KPTNQ9Y664 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPTNQ9Y664 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPTNQ9Y664 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPTNQ9Y664 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPTNQ9Y664 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPTNQ9Y664 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KPTNQ9Y664 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPTNQ9Y664 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPTNQ9Y664 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPTNQ9Y664 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPTNQ9Y664 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPTNQ9Y664 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPTNQ9Y664 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPTNQ9Y664 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPTNQ9Y664 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPTNQ9Y664 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPTNQ9Y664 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPTNQ9Y664 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPTNQ9Y664 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KPTNQ9Y664 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KPTNQ9Y664 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPTNQ9Y664 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KPTNQ9Y664 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KPTNQ9Y664 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPTNQ9Y664 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPTNQ9Y664 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPTNQ9Y664 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPTNQ9Y664 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KPTNQ9Y664 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPTNQ9Y664 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KPTNQ9Y664 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KPTNQ9Y664 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KPTNQ9Y664 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KPTNQ9Y664 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPTNQ9Y664 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPTNQ9Y664 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPTNQ9Y664 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPTNQ9Y664 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPTNQ9Y664 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPTNQ9Y664 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPTNQ9Y664 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPTNQ9Y664 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPTNQ9Y664 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPTNQ9Y664 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPTNQ9Y664 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPTNQ9Y664 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPTNQ9Y664 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPTNQ9Y664 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPTNQ9Y664 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPTNQ9Y664 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPTNQ9Y664 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPTNQ9Y664 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPTNQ9Y664 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPTNQ9Y664 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms