Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX5Q9Y5X3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX5Q9Y5X3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX5Q9Y5X3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX5Q9Y5X3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX5Q9Y5X3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX5Q9Y5X3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX5Q9Y5X3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX5Q9Y5X3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX5Q9Y5X3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX5Q9Y5X3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX5Q9Y5X3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX5Q9Y5X3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX5Q9Y5X3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX5Q9Y5X3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX5Q9Y5X3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX5Q9Y5X3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX5Q9Y5X3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX5Q9Y5X3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX5Q9Y5X3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX5Q9Y5X3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX5Q9Y5X3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX5Q9Y5X3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX5Q9Y5X3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX5Q9Y5X3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX5Q9Y5X3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX5Q9Y5X3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX5Q9Y5X3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX5Q9Y5X3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX5Q9Y5X3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX5Q9Y5X3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX5Q9Y5X3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX5Q9Y5X3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX5Q9Y5X3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX5Q9Y5X3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX5Q9Y5X3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX5Q9Y5X3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX5Q9Y5X3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX5Q9Y5X3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX5Q9Y5X3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX5Q9Y5X3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX5Q9Y5X3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX5Q9Y5X3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX5Q9Y5X3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX5Q9Y5X3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX5Q9Y5X3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX5Q9Y5X3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX5Q9Y5X3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX5Q9Y5X3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX5Q9Y5X3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX5Q9Y5X3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX5Q9Y5X3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX5Q9Y5X3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX5Q9Y5X3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX5Q9Y5X3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX5Q9Y5X3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX5Q9Y5X3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX5Q9Y5X3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX5Q9Y5X3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX5Q9Y5X3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX5Q9Y5X3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX5Q9Y5X3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX5Q9Y5X3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX5Q9Y5X3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX5Q9Y5X3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNX5Q9Y5X3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX5Q9Y5X3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX5Q9Y5X3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX5Q9Y5X3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX5Q9Y5X3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX5Q9Y5X3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX5Q9Y5X3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX5Q9Y5X3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX5Q9Y5X3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX5Q9Y5X3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX5Q9Y5X3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX5Q9Y5X3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX5Q9Y5X3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX5Q9Y5X3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX5Q9Y5X3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX5Q9Y5X3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX5Q9Y5X3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX5Q9Y5X3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX5Q9Y5X3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX5Q9Y5X3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX5Q9Y5X3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX5Q9Y5X3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX5Q9Y5X3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX5Q9Y5X3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX5Q9Y5X3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX5Q9Y5X3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX5Q9Y5X3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX5Q9Y5X3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX5Q9Y5X3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX5Q9Y5X3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX5Q9Y5X3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX5Q9Y5X3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX5Q9Y5X3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX5Q9Y5X3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX5Q9Y5X3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms