Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CSAG2Q9Y5P2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSAG2Q9Y5P2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSAG2Q9Y5P2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSAG2Q9Y5P2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSAG2Q9Y5P2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSAG2Q9Y5P2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSAG2Q9Y5P2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSAG2Q9Y5P2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSAG2Q9Y5P2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSAG2Q9Y5P2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSAG2Q9Y5P2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSAG2Q9Y5P2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSAG2Q9Y5P2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSAG2Q9Y5P2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSAG2Q9Y5P2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSAG2Q9Y5P2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSAG2Q9Y5P2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSAG2Q9Y5P2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSAG2Q9Y5P2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSAG2Q9Y5P2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSAG2Q9Y5P2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSAG2Q9Y5P2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSAG2Q9Y5P2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSAG2Q9Y5P2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSAG2Q9Y5P2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CSAG2Q9Y5P2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSAG2Q9Y5P2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSAG2Q9Y5P2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSAG2Q9Y5P2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSAG2Q9Y5P2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSAG2Q9Y5P2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSAG2Q9Y5P2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSAG2Q9Y5P2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CSAG2Q9Y5P2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSAG2Q9Y5P2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSAG2Q9Y5P2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSAG2Q9Y5P2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSAG2Q9Y5P2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSAG2Q9Y5P2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSAG2Q9Y5P2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSAG2Q9Y5P2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSAG2Q9Y5P2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSAG2Q9Y5P2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSAG2Q9Y5P2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSAG2Q9Y5P2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSAG2Q9Y5P2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSAG2Q9Y5P2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSAG2Q9Y5P2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSAG2Q9Y5P2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSAG2Q9Y5P2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSAG2Q9Y5P2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CSAG2Q9Y5P2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSAG2Q9Y5P2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSAG2Q9Y5P2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSAG2Q9Y5P2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CSAG2Q9Y5P2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CSAG2Q9Y5P2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSAG2Q9Y5P2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSAG2Q9Y5P2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSAG2Q9Y5P2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSAG2Q9Y5P2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSAG2Q9Y5P2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CSAG2Q9Y5P2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSAG2Q9Y5P2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSAG2Q9Y5P2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSAG2Q9Y5P2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSAG2Q9Y5P2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSAG2Q9Y5P2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSAG2Q9Y5P2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSAG2Q9Y5P2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CSAG2Q9Y5P2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSAG2Q9Y5P2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSAG2Q9Y5P2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSAG2Q9Y5P2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSAG2Q9Y5P2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSAG2Q9Y5P2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSAG2Q9Y5P2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSAG2Q9Y5P2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSAG2Q9Y5P2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSAG2Q9Y5P2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSAG2Q9Y5P2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSAG2Q9Y5P2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSAG2Q9Y5P2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSAG2Q9Y5P2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSAG2Q9Y5P2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSAG2Q9Y5P2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSAG2Q9Y5P2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSAG2Q9Y5P2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CSAG2Q9Y5P2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSAG2Q9Y5P2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSAG2Q9Y5P2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CSAG2Q9Y5P2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSAG2Q9Y5P2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSAG2Q9Y5P2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSAG2Q9Y5P2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSAG2Q9Y5P2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSAG2Q9Y5P2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSAG2Q9Y5P2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSAG2Q9Y5P2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms