Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN16Q9Y5I7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN16Q9Y5I7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN16Q9Y5I7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN16Q9Y5I7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN16Q9Y5I7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN16Q9Y5I7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN16Q9Y5I7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN16Q9Y5I7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN16Q9Y5I7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN16Q9Y5I7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN16Q9Y5I7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN16Q9Y5I7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN16Q9Y5I7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN16Q9Y5I7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN16Q9Y5I7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN16Q9Y5I7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDN16Q9Y5I7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN16Q9Y5I7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN16Q9Y5I7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN16Q9Y5I7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN16Q9Y5I7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLDN16Q9Y5I7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN16Q9Y5I7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN16Q9Y5I7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN16Q9Y5I7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN16Q9Y5I7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN16Q9Y5I7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN16Q9Y5I7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN16Q9Y5I7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN16Q9Y5I7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN16Q9Y5I7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN16Q9Y5I7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN16Q9Y5I7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN16Q9Y5I7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN16Q9Y5I7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN16Q9Y5I7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN16Q9Y5I7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN16Q9Y5I7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDN16Q9Y5I7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN16Q9Y5I7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN16Q9Y5I7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN16Q9Y5I7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN16Q9Y5I7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN16Q9Y5I7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLDN16Q9Y5I7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDN16Q9Y5I7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDN16Q9Y5I7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDN16Q9Y5I7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN16Q9Y5I7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN16Q9Y5I7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN16Q9Y5I7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN16Q9Y5I7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLDN16Q9Y5I7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLDN16Q9Y5I7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLDN16Q9Y5I7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLDN16Q9Y5I7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN16Q9Y5I7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLDN16Q9Y5I7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN16Q9Y5I7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN16Q9Y5I7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN16Q9Y5I7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN16Q9Y5I7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN16Q9Y5I7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN16Q9Y5I7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN16Q9Y5I7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN16Q9Y5I7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN16Q9Y5I7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN16Q9Y5I7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN16Q9Y5I7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLDN16Q9Y5I7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLDN16Q9Y5I7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLDN16Q9Y5I7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN16Q9Y5I7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN16Q9Y5I7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN16Q9Y5I7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDN16Q9Y5I7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDN16Q9Y5I7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDN16Q9Y5I7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN16Q9Y5I7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLDN16Q9Y5I7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLDN16Q9Y5I7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLDN16Q9Y5I7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN16Q9Y5I7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN16Q9Y5I7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLDN16Q9Y5I7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLDN16Q9Y5I7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLDN16Q9Y5I7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLDN16Q9Y5I7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDN16Q9Y5I7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLDN16Q9Y5I7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN16Q9Y5I7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN16Q9Y5I7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN16Q9Y5I7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDN16Q9Y5I7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLDN16Q9Y5I7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN16Q9Y5I7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN16Q9Y5I7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN16Q9Y5I7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.2 ms